馬來西亞理科大學的優勢專業有多媒體計算、網絡計算、軟件工程、智能系統、數學、數學模型、應用統計學、數學與經濟學、特殊教育、學前教育、城市與區域規劃、建筑學、室內設計、建筑技術、建筑管理等熱門專業。馬來西亞理科大學擁有28個學院，26個研究中心，8個研究平臺，10個服務中心。
優勢專業
藥劑及藥理學專業
馬來西亞理科大學藥學院，提供藥物化學、制藥技術、藥理學、生理學、臨床藥學以及社會和管理藥學等多門，在2021年QS世界大學學科排名當中藥劑與藥理學專業排名當中位列第75位。
建筑學及建筑環境專業
馬來西亞理科大學住房、建筑和規劃學院是馬來西亞理科大學的熱門學院之一，學院開設了建筑、室內設計、建筑測量、建筑技術、施工管理、城市和區域規劃以及工料測量七個本科課程，并獲得了各個專業學科機構的認證。例如：馬來西亞建筑師學會、馬來西亞建筑師委員會、馬來西亞皇家測量師學會、英國皇家特許測量師學會、亞太區工料測量師協會和馬來西亞規劃師學會。
除此之外住房、建筑和規劃學院還提供碩士和博士學位的課程和研究，研究方向寬廣，涵蓋建筑技術、城市規劃、項目管理、建筑、景觀建筑、室內設計、住房和工料測量八大領域。在2021年QS世界大學學科排名當中建筑學和建筑環境專業排名第101位。
化學工程專業
馬來西亞理科大學化學科學學院是馬來西亞最大的化學學院之一，學院遵循自由和多學科性質的研究體系，提供本科至博士階段的各類化學專業課程，課程涵蓋有機化學、物理化學、無機化學、工業化學、分析化學等專業方向。在2021年QS世界大學學科排名當中化學工程排名第101位
語言與文學專業
馬來西亞理科大學人文文學院，馬來西亞國內領先的人文學院之一。人文學院作為人文學科的中心，其學術領域廣泛，涵蓋了哲學、文明、宗教、語言、文學、歷史、地理和翻譯等眾多學科。人文學院也作為學術中心，設立了三門文學學士課程，分別是文學、英語語言及文學研究、翻譯及口譯。
在2021年QS世界大學學科排名當中英語語言與文學排名175位；地理學排名181位；語言學283位。
傳媒研究專業
馬來西亞理科大學傳媒學院是馬來西亞傳媒研究的先驅，傳媒學院提供學士至博士階段多門課程，專業領域包括傳播、新聞業、公共關系、廣告、電影和廣播、媒體與文化研究、人際交往等學科。除專業教學外，學校還為學生提供傳媒相關的社會、文化、政治、歷史維度相關的廣泛知識。在2021年QS世界大學學科排名當中傳媒研究專業位列第151位。
